小规模纳税人公司注销和一般纳税人公司注销存在以下区别：

税务处理方面

• 查账要求：

• 小规模纳税人：若选择简易注销，通常无需查账，在电子税务局提交注销申请，进行清税申报即可。若为一般注销，税务流程与一般纳税人相似，但账务相对简单，被查账的概率和复杂程度可能较低。

• 一般纳税人：一般采用一般注销流程，需走专管员查账流程。税务专管员会查看企业以往的账本及报表，检查账务是否合规、税是否漏报等，如有问题需改账补税，甚至可能涉及罚金。

• 税务资料：

• 小规模纳税人：税务资料相对较少，如无特殊情况，通常准备近一年的财务报表、税务申报表等即可。

• 一般纳税人：因业务复杂，需准备的资料更多，可能包括企业最近 2 至 3 年所有的会计凭证、账簿、银行对账单、完税凭证、各种开票设备等。

办理周期方面

• 小规模纳税人：适用简易注销时，加上公示期通常一个月左右可办理完结；即使是一般注销，因财务和业务相对简单，若无复杂税务问题，办理周期也相对较短。

• 一般纳税人：由于查账等流程较为复杂，且可能存在税务调整等情况，办理周期较长，具体时长取决于公司的经营状况、债权债务清理情况等因素。

注销流程方面

• 小规模纳税人：适用简易注销程序的企业不再进行清算组备案和登报公告，直接在 “国家企业信用信息公示系统” 上发布简易注销登记公告，也无需提交清算报告、清算组备案证明等材料。

• 一般纳税人：需按规定流程进行清算组备案、登报公告、提交清算报告等步骤，流程相对繁琐。

发票及税控设备处理方面

• 小规模纳税人：可能未购买税盘，或使用税务 UKey 等较为简单的开票设备，注销时只需将空白发票作废，携带相关设备到税局注销即可。

• 一般纳税人：通常使用金税盘、税控盘等设备，且发票种类和数量较多，需先在开票软件中作废空白发票，然后携带税控盘等设备到税局进行注销，同时要确保发票开具和申报情况准确无误。